Guna melengkapi kebutuhan sarana dan prasarana pendukung pembelajaran pada Program Studi Sistem Informasi Kelautan maka akan dikembangkan secara bertahap beberapa laboratorium, diantaranya:
- Laboratorium Ekologi Kelautan
- Laboratorium Komputer
- Laboratorium Kualitas Air
Selain itu, beberapa fasilitas lainnya yang terdapat pada Program Studi Sistem Informasi Kelautan antara lain:
- Ruang Kuliah dengan jaringan
- Internet
- Perpustakaan dengan buku dan jurnal kelautan dan perikanan
- Lapangan.